Na místě dnešního zámku stál v předhusitské době dvůr Leptač. Po husitských válkách získali dvůr Rožmberkové. Ti jej darovali Jakubovi Krčínovi. Ten nechal v jeho sousedství postavit tvrz Nový Leptač. Okolí tohoto sídla bylo plné zvěře, a tak tu Vilém z Rožmberka založil velkou oboru na králíky. Vilém si zdejší místo oblíbil a odkoupil tvrz od Krčína. Přejmenoval tvrz na Kratochvíli a nechal ji přestavět na renesanční zámek. Zámek byl přestavěn pod vlivem italské vily pod vedením Baltazara Maggiho z Arona. Zdejší krajina byla dost podmáčená, a tak byly objekty zpevněny dubovými a olšovými piloty. Vilém sem jezdil často na lov a po jeho smrti byl objekt využíván jeho bratrem Petrem Vokem. Petr Vok byl nucen pro dluhy Netolicko i Krumlovsko prodat císaři Rudolfu II.
Pak se stali majiteli Eggenberkové a Schwarzenberkové. Na počátku 19. století zde byly byty a po nich muzeum. Roku 1981 zde byla umístěna expozice českého animovaného filmu. V zámecké zahradě se pořádá divadlo. V kostele se konají varhanní a vokální koncerty.