Historie kostela se začala psát v roce 1640 spolu s příchodem vzdělávacího řádu piaristů do Litomyšle. Když bylo piaristické gymnázium v roce 1644 dostavěno, stály už tři křídla koleje s malým kostelíkem na místě dnešního chrámu. V roce 1714 se započalo s výstavbou nového kostela podle významného italského architekta Giovanni Battisty Alliprandiho v barokním slohu, po jeho smrti se o dokončení stavby postaral F. M. Kaňka. Fasádu na průčelí zdobí sochy z dílny M. B. Brauna a obraz na hlavním oltáři pochází od F. Trevisaniho.
Dnes můžeme na kostelu obdivovat pouze jeho exteriér. Ten se svými dvěma majestátními věžemi a novou fasádou působí zdravým dojmem. Kostelní zdi však skrývají obraz zkázy. Obnažené cihly, demontované zařízení a kompletně zničené varhany pocházející z dílny kutnohorského varhanáře Horáka jsou následkem dlouholetých snah minulého režimu o zlikvidování této vznešené stavby. V kooperaci s nelidským chováním vandalů se mu to málem podařilo. Chrám však stojí dál a trpělivě čeká na svou celkovou rekonstrukci. V přilehlých budovách, původních kolejích, působí studenti fakulty restaurování. Bývalá budova školy stojící vedle kostela dnes slouží jako muzeum a galerie.
