Do Svaté trnové koruny (Sancta Spinea Corona) povolal cisterciáky z rakouského kláštera Heiligenkreuz český panovník Přemysl Otakar II. roku 1263. Tento klášter dal postavit kvůli rozpínavosti rodu Vítkovců, kteří sídlili na Českém Krumlově. K objektu patřilo mnoho pozemků, což mu zajistilo ve 14.století velký rozkvět. Tato slavná doba pohasla za husitských válek, kdy byl klášter vypálen a značně poškozen.
Mniši zničené místo na 17 let opustili. Toho využili Rožmberkové, kteří získali klášterní statky, neboť mniši neměli prostředky na jejich údržbu. Po třicetileté válce se do objektu značně investovalo. Ve 2.polovině 17. století se klášter řadil mezi vzorové. Za další rozkvět vděčil opatovi Bohumíru Bylanskému, který se staral o hmotnou a hlavně duchovní stránku. Tento pokrok byl nečekaně ukončen roku 1785 zrušovacím dekretem císaře Josefa II.
Od té doby zde řeholní život definitivně skončil. Dalšími majiteli se stali Schwarzenberkové, kteří zde zřídili nevhodné průmyslové provozy. Po ukončení těchto provozů se začalo pod vedením architekta Fidry s opravou klášterních budov. Návštěvníci se můžou těšit na dvě prohlídkové trasy. Čas od času se zde pořádají hudební festivaly a podobné akce. Klášter je považován za jeden z cenných komplexů gotické architektury ve střední Evropě.
